2012年普通高校自主选拔合格、艺术特长生测试合格取得高校入选资格的考生均须在5月13日～15日期间登录浙江教育考试网高考报名系统，选择“志愿填报”功能，在本人取得入选资格的高校中选择填报志愿，并提交确认。放弃所有高校入选资格的考生，必须选择“放弃填报”，并说明具体原因。
志愿填报后，考生自主打印《浙江省2012年普通高校自主选拔考生、艺术特长生志愿表》一式三份，考生本人及其法定监护人亲笔签名后，交高考报名地市、县(市、区)招办(考试院、考试中心)(以下简称招生考试机构)，有关招生考试机构复核确认后盖章，考生、当地招生考试机构各留存一份，另一份由设区市招生考试机构汇总。
市招办的老师提醒说，考生不得兼报自主选拔与艺术特长生，且只能选择一所高校填报，否则志愿无效。同时获得多所高校入选资格的考生，选择其中一所后，即自动放弃其他高校入选资格。“按规定，高校自主招生、艺术特长生在普通高校第一批提前录取最后一天单独投档，本次所填志愿是投档的唯一依据。考生本人及其法定监护人须对志愿(包括放弃志愿)予以书面签名确认。如不按规定确认影响录取的，由考生本人负责。”